משרד החוץ נערך למתקפת הסברה נגדית על "מתקפת התעמולה השקרית של הפלסטינים בג'נין". זאת, בעקבות הידיעות על כך שהפלסטינים מתכוונים לאסוף גופות ולערום אותן ברחובות על מנת להציג טבח-לכאורה שישראל ביצעה בפלסטינים.
לעומת זאת, גורמי הסברה טוענים כי "מערכת ההסברה לא נערכה כראוי למצגי הגופות שהפלסטינים יציגו לעולם". גורמי ההסברה קראו לישראל לא להסתפק בפעולת הסברה ולנקוט בפעולה שתמנע מהפלסטינים להציג את הגופות לראווה.
"הצבא המוסרי בעולם"
לדברי גדעון מאיר, סמנכ"ל תקשורת והסברה, "הניסיון של הפלסטינים להציג את הפעולה בג'נין כטבח יהיה "נרטיב פלסטיני ידוע. אך בניגוד לפלסטינים שפועלים על פי כללי מוסר שידועים לכולם, צה"ל הוא הצבא המוסרי ביותר שקיים היום בעולם, ולכן נערך מערך ההסברה להעביר לנציגויות השונות של ישראל בעולם את המסרים שאמורים להציג את התמונה כהוויתה".
בין היתר, התבקשו נציגויות ישראל להדגיש את העובדה שצה"ל פנה לגורמי רפואה בסהר האדום בדרישה לפנות פצועים והרוגים, אך נענה בשלילה. בנוסף, התבקשו נציגויות ישראל להסביר כי כל טענה הנוגעת לטבח מכוון בג'נין היא צינית ומרושעת. הטרוריסטים, לדברי משרד החוץ, הקימו את מפקדותיהן, מעבדות הנפץ ומחסני הנשק, דווקא במחנות פליטים צפופים באנשים. לפלסטינים גם ניתנה האפשרות להיכנע, אבל הם העדיפו לקפח את חייהם ואת חיי כמה שיותר חיילים.
עוד נמסר מהמשרד כי צה"ל פועל בזהירות הגדולה ביותר האפשרית כדי להימנע מפגיעה באזרחים, ויעיד על כך המעבר מבית לבית תחת אש תופת ומחבלים מתאבדים.
מסר נוסף שנקראים נציגי משרד החוץ להעביר נוגע לשימוש הציני שעושים הפלסטינים בהרוגיהם ובפצועיהם, רובם, לדברי משרד החוץ הם טרוריסטים חמושים ומתאבדים שנלחמו בחיילי צה"ל ואף הצליחו לפגוע ברבים מחייליו.
דני סימן, מנהל לשכת העיתונות הממשלתית, אמר כי בפגישה שקיים עם דובר צה"ל, הוא קרא לו לשקול להתיר כניסה של עיתונאים לאזורי הקרבות לפני יציאת כוחות צה"ל, זאת במטרה למנוע מהפלסטינים להציג מצג שווא כלפי התקשורת.
"קטסטרופה ידועה מראש"
גורם הסברה ישראלי אומר כי התמונה שהפלסטינים יציגו בג'נין חושפת "כרוניקה של קטסטרופה ידועה מראש". לדבריו, גורמי ההסברה הישראלים לא נערכים להתמודד עם התמונות שהפלסטינים עומדים להציג בשטח והדבר מעורר ויכוחים קשים בקרב גורמי ההסברה הישראלים.