בדיקת משרד מבקר המדינה חשפה ליקויים קשים בתפקוד בתי המשפט לענייני משפחה. בתי משפט אלה, הפועלים במסגרת בתי משפט השלום, אמונים על הטיפול בנושאי אישות, מזונות, אבהות ומשמורת קטינים.
מהבדיקה עולה כי ביותר מ-50 אחוזים מהתיקים שנבדקו קיימים ליקויים. בין השאר עולה כי ב-13 אחוזים מהתיקים לא ביצעה מזכירות בתי המשפט מעקב, שהיה עשוי למנוע מצב שבו לא ננקטה כל פעולה בתיקים פתוחים. בנוסף, במחשב ביהמ"ש נמצאו רישומים לא נכונים ולא מעודכנים אודות התפתחויות חשובות שחלו בתיקים, כגון מתן פסקי דין.
המבקר מציין כי חסרים נוהלי עבודה כתובים וקבועים במזכירויות בתי המשפט ברחבי הארץ. כמו כן, אין הליך סדיר של בקרת איכות על הטיפול בתיקים במזכירויות, כך לדוגמא החלטות ביהמ"ש אינן נשלחות דרך קבע למתדיינים, אלא במקרים דחופים בלבד.
המבקר מציין כי על מנת לייעל ולזרז את הטיפול בתיקים, שנמשך לעיתים מספר שנים, על הנהלת בתי המשפט לקבוע אמות מידה לפרקי זמן נאותים לצורך מעקב, ולייעל את סדרי העבודה והבקרה, בין השאר על ידי שיפור מערכת המחשב.
עוד נמצאו ליקויים בנוהלי פניית קטינים לבית המשפט. בחוק נקבע שקטין רשאי להגיש בעצמו תובענה לביהמ"ש, שלא באמצעות אפוטרופוס, בכל עניין שבו זכותו עלולה להיפגע פגיעה של ממש. אולם המבקר מציין כי בחוק לא נקבע הסדר של מינוי עו"ד שייצג את הקטין, וכמו כן לא נקבעו רשות או גוף שתפקידם ליידע את הקטין בדבר זכויותיו או לסייע לקטינים הזקוקים לייצוג.