האפשרות שגדודי חללי אל אקצה, הזרוע הצבאית של הפתח, עומדת מאחורי הפיגוע הבוקר בכפר סבא, בין אם באופן נפרד ובין אם במשותף עם החזית העממית, הפתיעה את ראשי הארגון והרשות הפלסטינית. עם זאת, הם העדיפו לא למתוח ביקורת פומבית על הפיגוע.
על הקשר בין הפיגוע לבין הקמת הממשלה החדשה ברשות, לא ששו לדבר מרבית בכירי הרשות והפתח. בכיר פלסטיני, איש הפתח, אומר כי "מעורבות גדודי אל-אקצה בפיגוע מציבה באור מביך וקשה את הרשות, ובמיוחד את ראש הממשלה החדש, אבו-מאזן, הן מול הקהילה הבינלאומית, והן מול הפלגים הפלסטינים האחרים".
לדברי הבכיר, "הדיאלוג יהיה הדרך לנסות ולפתור את המחלוקת עם הפלגים השונים ולהבהיר להם את חומרת הדברים. הפיגועים בכלל, והפיגוע הבוקר, מחבלים ומטרפדים במאמץ הפלסטיני לדחוק את ישראל לפינה, תחת לחץ בינלאומי בנוגע ליישום מפת הדרכים, כשברור לנו ששרון אינו מעוניין בה".
הבכיר אמר כי מהיכרות עם הנפשות הפועלות בממשלה החדשה, "הדיאלוג עם הפלגים יהיה קצר, בלי הרבה סבלנות ובלי הרבה מרחב תמרון". לדבריו, "גם כלפי גדודי אל-אקצה תינקט אותה גישה שתינקט נגד החמאס והג'יהאד".
"אין לצפות להפסקה בפיגועים"
לעומתו, חבר המועצה המחוקקת הפלסטינית, פארס קדורה, מראשי התנזים של הפתח, אמר בתגובה לפיגוע, כי "אין לצפות להפסקה אוטומטית של הפיגועים רק בגלל שלפני 24 שעות הוקמה ממשלה חדשה, בוודאי לא כשישראל ממשיכה בפעולותיה נגד העם הפלסטיני".
קדורה הוסיף ש"אין לצפות להפסקת הפיגועים ללא אופק מדיני וללא הבטחת שלומם של פעילי האינתיפאדה והמבוקשים ומתן ערבויות כי הם לא ייפגעו".
חוסיין א-שייח', מראשי התנזים של הפתח, אמר כי "כאשר ממשלת ישראל ממשיכה בפשעים נגד הפלסטינים, שאף אחד לא יצפה מהפלסטינים שיעניקו ביטחון בחינם לישראל. רק בחודש הנוכחי נהרגו כבר 47 פלסטינים".
חמאס: אבו מאזן לא מייצג אפילו את הפתח
ד"ר עבד אל-עזיז רנטיסי, מראשי החמאס, אמר כי הפיגוע משקף את העובדה שהעם הפלסטיני דבק עדיין בדרך המאבק ודרך הפיגועים.
לדבריו, "בפיגוע הזה מבהיר העם הפלסטיני את הסדר. הוא מבהיר שמה שצריך להסתיים קודם ולפני הפיגועים הוא הכיבוש, שהוא הסיבה לפיגועים". לדברי רנטיסי, אם נכונים הדיווחים כי גדודי אל-אקצה של הפתח ביצעו את הפיגוע, "הרי שזה מוכיח שמי שמדבר על הפסקת הפיגועים והפסקת האופי הצבאי של האינתיפאדה, אינו מייצג אפילו את הפתח, אלא מייצג רק את עצמו". רנטיסי רמז לעמדתו של אבו-מאזן. רנטיסי הוסיף כי אין עדיין כל דיאלוג חדש בין החמאס לממשלה החדשה.