ד"ר שטיין משמש מנהל המחלקה הפסיכוסומטית לילדים בבית החולים לילדים ספרא, שבמרכז הרפואי שיבא תל השומר.
קודם לכן, שימש מנהל מחלקת נוער במרכז לבריאות הנפש אברבנאל בבת ים.
ד"ר שטיין מרצה בכיר בפקולטה לרפואה באוניברסיטת תל אביב. הוא כתב כ-80 מאמרים בנושאים שונים הקשורים לפסיכיאטריה ולפסיכיאטריה של הילד והמתבגר.