ראש עיריית חיפה, יונה יהב, הורה להפסיק לאלתר כל פעילות ספורט ימי של בני נוער בנחל הקישון. זאת, בעקבות החשיפה ב"ידיעות אחרונות" כי בתי ספר ואגודות שיט עירוניות ממשיכים לשייט בתחום הימי שוועדת שמגר קבעה כי הוא מזוהם ומהווה סכנה בריאותית.
בוגרי הקומנדו הימי שלקו במחלת הסרטן גילו לתדהמתם, בעת שסיירו שקיימו לאחרונה באזור הקישון, עשרות בני נוער המשייטים בשטח הימי שהוגדר על ידי ועדת שמגר כמסוכן. ועדת שמגר בדקה את ההשלכות של פעילות צבאית בנחל הקישון ומימי הסביבה על בריאותם של חיילי צה"ל ובדו"ח שפירסמה הדגישה כי חל "איסור גם על כל פעילות ספורט שחיה, חתירה או אימונים מימיים של תנועות ספורט ותנועות נוער במימי הקישון".
למרות זאת לא מולאה ההנחיה. בעקבות הפירסום ב"ידיעות אחרונות" יצאה הנחייה גורפת מעיריית חיפה לכל הגורמים הפועלים בקישון, האוסרת פעילות ימית. צורפה גם מפה המפרטת את האזורים המסוכנים על פי קביעת ועדת שמגר. העירייה תפעל לחפש אלטרנטיבות לחידוש הפעילות הימית במקום אחר.
יובל תמיר, איש השייטת שלקה בסרטן, כתב לראש עירית חיפה: "צריך לב של אבן כדי להתעלם מההנחיות של ועדת שמגר ולסכן בצורה כה ברוטאלית את חייהם של אלפי תלמידים באזור חיפה והצפון. חברי ואני שנפגענו מהקישון, חווים על בשרנו את מחירה המר של המחלה הנוראה ואת הייסורים שהיא גורמת יום יום. אני לא מסוגל להירדם בלילה מעצם המחשבה כי מדי יום נשלחים עוד ילדים לשוט בקישון".