ארגון אל קאעידה נערך לתקיפה כימית או ביולוגית על מטוס. התרעות מסוג זה כבר גרמו לביטולן של מספר טיסות בארה"ב, כך דיווח הבוקר (יום א') העיתון "וושינגטון פוסט", שציטט גורמי ממשל אמריקנים.
שלושה גורמי מודיעין שצוטטו בעיתון הסבירו, כי ההתרעות מתייחסות לאפשרות שהארגון יפיץ במטוסים נגיפי אבעבועות שחורות או אנתרקס, ונוסעי המטוס יגרמו להפצת הנגיף לאחר הנחיתה, מבלי להרגיש בכך.
כמו כן, ההתרעות התייחסו לאפשרות של חטיפת מטוס בעזרת חומר כימי שיגרום לטשטוש הנוסעים וצוות המטוס, או, לחילופין, להטמין בתא המטען של המטוס חומר רדיואקטיבי.
חברת התעופה "קונטיננטל" ביטלה את טיסתה מגלזגו לניו יורק בשל ההתרעות. גם חברת התעופה הבריטית "בריטיש איירווייס" הודיעה בשבת על ביטולן של חמש טיסות לארה"ב, ארבע לוושינגטון ואחת למיאמי.
חברת התעופה הצרפתית "אייר פראנס" הודיעה על ביטולן של שתי טיסותיה היומיות מפאריס לוושינגטון ביומיים הקרובים, עקב "סיבות ביטחוניות". מקור אמריקני הודיע כי הטיסות בוטלו עקב "איום ספציפי של ארגון אל-קאעידה".
גורמי ממשל אמריקנים הסבירו, כי קל יותר לבטל את טיסות מאשר לנסות ולמלא אחר דרישות הביטחון הבלתי אפשריות שהוחמרו מאוד בעקבות ההתרעות.