שירותי הביון האמריקנים, ה-CIA, מחזיקים וחוקרים בכירי אל-קאעידה בבתי סוהר סודיים במזרח אירופה, הידועים לשימצה מהתקופה הסובייטית. כך חשף הבוקר (יום ד') ה"וושינגטון פוסט" האמריקני. המתקנים הסודיים ממוקמים בחמש מדינות מזרח אירופאיות, כיום דמוקרטיות, וכמו-כן באפגניסטן, תאילנד ובמפרץ גאוונטנמו בקובה.
ה"פוסט" טען בדיווחו כי אינו מפרסם את שמות המדינות המזרח אירופאיות המעורבות בתוכנית לבקשת בכירים בממשל האמריקני, שטענו כי הגילוי עלול לחבל במאמץ המלחמה בטרור במדינות אלו ובמקומות אחרים ועלול להפוך את המדינות הללו לקורבנות של התקפות טרור לשם נקמה.
מערכת הכליאה הסודית הבינלאומית היא מרכיב מרכזי במלחמה הבלתי קונבנציונלית של ארה"ב בטרוריסטים. היא תלויה בשיתוף פעולה של שירותי מודיעין זרים ובשמירת מידע בסיסי בסוד מפני מרבית חברי הקונגרס האמריקני.
הקיום והמיקום של מתקני הכליאה של בכירי אל-קאעידה מוגדרים במסמכים של הבית הלבן, הפנטגון ומחלקת המדינה כ"חורים שחורים" ועליהם יודעים רק קומץ של אישים בארה"ב ובמדינות שבתחומן עצורים הבכירים. המעצרים מתבצעים דווקא במדינות אלה, מכיוון ששם הם לא כפופים למגבלות בית הדין הצבאי-אמריקני.
המדינות המארחות חתומות על אמנת ג'נבה, האוסרת עינויים והשפלות בלתי אנושיות, אבל חקירת ה-CIA בבתי הכלא המדוברים נעשית בטכניקות חקירה המותרות לחוקרי הסוכנות מעבר לים.
יותר ממאה חשודים בטרור נשלחו על-ידי ה-CIA למערכת בתי הסוהר הסודית. מספר זה אינו כולל עצירים שנלקחו מעיראק. בערך 30 עצירים הם טרוריסטים בכירים הקשורים ישירות לטרור. הם מוחזקים בבידוד מוחלט מהעולם, בחושך, לעיתים בתאים תת-קרקעיים, ואף אחד מלבד אנשי ה-CIA אינו יכול לדבר אתם ואפילו לראותם.
יותר מ-70 עצירים אחרים, פחות חשובים, הועברו לשירותי המודיעין במצרים, ירדן, מרוקו, אפגניסטן ומדינות אחרות, לבתי כלא המוחזקים על-ידי המדינות המארחות.