לאחרונה החל משרד החינוך לקדם תוכנית לימודים חדשה בנושא "זהות ונטייה מינית" למאבק בהומופוביה ולסבופוביה במערכת החינוך. התוכנית החדשה נועדה לאפשר לתלמידים לקבל מידע עשיר ומגוון בסוגיות הקשורות ל"גיבוש זהות מינית שונה", ושמה על השולחן מונחים שעד היום נחשבו בגדר טאבו במשרד החינוך. למשל, שיחה על ההגדרות הבסיסיות של זהות מינית הכוללות זהות הטרוסקסואלית, לסבית, הומוסקסואלית, ביסקסואלית, טרנסקסואלית וטרנסג'נדרית.
המחנכים מונחים כיצד לדבר על הנושא בכיתה. כך למשל מוצע "לא להניח מראש שכל קשר זוגי הוא בהכרח הטרוסקסואלי: כאשר אנו משוחחים עם מתבגר או מתבגרת רצוי להשתמש בשפה ניטרלית עד כמה שאפשר או בכל האופציות הקיימות. לדוגמה: "האם יש לך קשר".
התוכנית כוללת גם מאמרים בנושא "ההיסטוריה של ההומוסקסואליות", סיפורים אישיים של יוצאים מהארון ביניהם מורה לסבית, מילון מונחים שימושי בנושאים הקשורים להומוסקסואליות, עצות למחנכים כיצד להתמודד עם סביבה הומופובית בכיתה ועוד.
השר נהרי הוסיף ש"כאיש חינוך אני רואה בחומרה את העובדה שתוכנית זו פורסמה שלא על דעת ההורים, שקרוב לוודאי אינם חפצים בהעלאת הנושא באופן פומבי ומסוכן בפני התלמידים ללא כל צורך חינוכי של ממש.
"חמורה במיוחד העובדה כי משרד החינוך התאים את תוכנית הלימודים לאירועים שנקבעו על ידי ארגונים הומוסקסואלים בלא שהדבר נקבע כמועד רשמי על ידי בית המחוקקים או אפילו באמצעות חוזר מנכ"ל, כך שבפועל נכפית תוכנית הלימודים על תלמידי ישראל בלא שהיה לנבחרי הציבור ולהורים היכולת לומר את דברם על כך. כמי שטובת מערכת החינוך וטובת ישראל עומדת לנגד עיניו אני קורא לך להורות על ביטול התוכנית האמורה ועל הסרתה לאלתר מאתריו הרשמיים של משרד החינוך".
שרת החינוך, פרופ' יולי תמיר, אמרה בתגובה כי "התפקיד המרכזי של מערכת החינוך הוא לעודד בקרב האזרחים בכלל והצעירים שבהם בפרט, נכונות ופתיחות לקבל את השונה בהבנה ובסובלנות. קידום הרב תרבותיות, השוויוניות והסובלנות, הם עמודי התווך של הפעילות החינוכית. מערכת החינוך מחויבת לתת מענה וסיוע לאזרחים הצעירים הנתקלים במשבר זהות מכל סוג שהוא; יהא זה בשל ארץ מוצאם או יהא זה בשל זהותם המינית, תוך יחס אישי, אנושי ומקצועי".
עוד אמרה השרה כי "במהלך כהונתי כשרת החינוך של מדינת ישראל אפעל לשילוב התפיסה הסובלנית במערכת החינוך, שתאפשר לאדם באשר הוא אדם את חופש הבחירה האישית בעיצוב דמותו ודרכו".