רשויות ניירות הערך מנהלות חקירה נגד סאניו בחשד לניפוח הכנסות. לפי דיווחים בתקשורת היפנית, סאניו ספגה הפסדים של 190 מיליארד ין (1.63 מיליארד דולר) בחברות הבנות שלה בשנת 2003, אך דיווחה על הפסדים בהיקף של 50 מיליארד ין בלבד (429 מיליון דולר).
לפי הדיווחים, נונאקה התפטרה בגלל סירוב מועצת המנהלים של סאניו לחקור באופן מלא את החשדות לאי סדרים בספרי החשבונות. לדברי אנליסטים, עזיבתה של נונאקה משקפת את מאבק הכוחות המשולש בחברה שכולל אותה, את הנשיא טושימאסה איו (בן למשפחת המייסדים) ואת בעלי המניות הגדולים.
נונאקה, עיתונאית לשעבר, מונתה ליו"רית ומנכ"לית סאניו ב-2005, והצטרפה למספר המצומצם מאוד של נשים ש"מככבות" כמנהלות בכירות בחברות יפניות גדולות.
פגיעה מתחרות ומרעידת אדמה
כמו יצרניות אלקטרוניקה יפניות אחרות, גם סאניו נפגעה בשנים האחרונות מהתחרות מצד יריבות אסיאתיות זולות יותר. ביצועי החברה נפגעו גם מרעידת אדמה שהתרחשה ב-2004 ליד מפעל ייצור השבבים שלה.
החברה מנסה לשקם את עסקיה באמצעות קיצוץ של כ-14 אלף משרות (15% מכוח העבודה שלה) ושטח מפעלים, וכן ויתור על חלק מעסקיה במסגרת תוכנית רה-ארגון עליה הכריזה ב-2004.
לפני שנה גייסה סאניו כ-2.6 מיליארד דולר מקבוצת משקיעים שכללה את גולדמן זאקס, דאיווה סקיוריטיז וסומיטומו מיצואי בנקאות. המשקיעים החדשים תפסו 5 מ-9 המושבים במועצת המנהלים של החברה. בחודש שעבר אמרה סאניו כי תבחן מחדש את דו"חותיה, וכי היא עשויה לתקן את התוצאות הפיננסיות של ארבע השנים עד מרץ 2004.