שואי-ביאן הואשם בגניבה של כ-21 מיליון דולר מקופת הממשלה. הוא הודה שהגיש קבלות מזויפות כדי לקבל החזרים כספיים מהמדינה, אך התעקש כי לא שילשל את הכספים לכיסו, אלא מימן באמצעותם "משימות דיפלומטיות חשאיות"
"הפשעים של הנשיא לשעבר הם חמורים", אמר דובר מטעם התביעה המקומית, "אנו נבקש להטיל עליו עונש חמור". שואי-ביאן נחשב לתומך נלהב בעצמאות טיוואן מסין. הוא כיהן כנשיא בין השנים 2000 ל-2008 ונחשב למקורב לממשל בארצות הברית.
לאורך משפטו, הוא הכחיש את עבירות השחיתות בהן הואשם וטען כי מדובר בעלילה על רקע פוליטי. תומכיו של שואי-ביאן הפגינו ברחובות טייוואן מאז שהתחיל משפטו של מנהיגים בעבר.
התביעה המקומית העמידה לדין גם את אשתו, בנו, חמותו ועוד 11 בני משפחה ועוזרים, בגין מעורבות בעבירות השחיתות שנחקרו במשך שנתיים.