בנו של מאמן נבחרת השחייה האמריקנית, פרנק בוש, דיווח כי פלפס שוקל להשתתף באולימפיאדת ריו ב-2016. הדיווח פורסם באתר של תחנת חדשות בפלורידה שבה משמש בנו של פרנק, פיטר, כמגיש החדשות.
לא חלף זמן רב, עד שפלפס התייחס לדיווח בחשבון הטוויטר שלו, אך לא הכחיש אותו. "למה אני ממשיך לקבל הודעות בנוגע לחזרה שלי להתחרות? אנשים באמת מאמינים לכל דבר שהם שמעו או ראו? יש בעולם יותר מדי אנשים שחושבים שיש להם 'סיפור'", צייץ פלפס בזלזול.
אולם פלפס לא הסתפק בכך, ו-20 דקות לאחר הציוץ הראשון, הוסיף אחד נוסף ורשם "אלו שיש להם ידע לא חוזים. אלו שחוזים - אין להם ידע". בוש הגיב וכתב כי הוא "בטוח מאוד" במידע שברשותו והזמן יעשה את שלו.
במהלך אולימפיאדת לונדון הפך פלפס לספורטאי המעוטר בתולדות המשחקים עם 22 מדליות, 18 מהן זהב. כמו כן, הוא אלוף העולם המעוטר ביותר, וברשותו 33 מדליות בסך הכול, בהן 26 מדליות זהב, 6 מדליות כסף ומדליית ארד אחת מ-6 אליפויות עולם.