עוד לפני הזכייה בסופרבול עם דנבר, אחרי הניצחון על קרוליינה, הסתמן שמאנינג יחליט לפרוש. היכולת שלו הידרדרה בצורה ניכרת, הוא התמודד עם פציעה במהלך העונה ולא בטוח שהברונקוס היו ממשיכים לתת לו את הקרדיט. האליפות סיפקה עבורו פרק סיום מושלם.
מאנינג שיחק 14 עונות באינדיאנפוליס, וסבל מפציעה קשה בצוואר שאילצה אותו לעבור ניתוח ולהחמיץ את עונת 2011. הקולטס, איתם זכה באליפות אחת והגיע לסופרבול נוסף, החליפו אותו בבחירה הראשונה בדראפט אנדרו לאק, והוא מצדו חתם בדנבר - שידוך שהתברר כנהדר. בשלוש עונות בקבוצה, מאנינג הגיע פעמיים לסופרבול, וכאמור, לקח אליפות אחת.
הוא יעזוב את האן-אף-אל עם רשימת שיאים מדהימה, את חלקם שבר השנה. מאנינג הוא שיאן כל הזמנים במסירות לטאצ'דאון (539) ויארדים במסירה (71.940), ובנוסף הוא שווה לברט פארב עם מספר הניצחונות הגדול ביותר לקוורטרבק, 186.