יניב בורגר מונה למאמנה של הפועל באר שבע מהליגה הלאומית. הקבוצה סיימה במקום השלישי בעונה שעברה והודחה בהפתעה גדולה כבר ברבע גמר הפלייאוף ע"י עירוני רעננה. בעקבות התוצאה החליטו במועדון לזעזע את המערכת ונפרדו מישראל ברוך שהעלה את הקבוצה מליגה ב' עד ללאומית.
החוזה שנחתם עם בורגר הוא לשנה אחת פלוס שנה נוספת במידה וב"ש תצליח להעפיל לליגת העל. בורגר עבד בשנה וחצי האחרונות כעוזרו של צביקה שרף במכבי אשדוד. בשבועות האחרונים הוא היה מועמד להמשיך בקבוצה כמאמן ראשי, אבל בסופו של דבר הנהלת אשדוד בחרה ללכת עם מאיר טפירו.
עוד קודם לכן שימש כמאמן ראשי בברק נתניה בליגת העל, כאשר החליף את רובי בלינקו ב-2012/13 וסיים את העונה במאזן של 5 ניצחונות ו-12 הפסדים. כמו כן, עבד בעירוני ר"ג והפועל לב השרון מהליגה השנייה.