חברת קומפיוג'ן, חברת הביוטכנולוגיה הישראלית הנסחרת בנאסדא"ק, הכריזה היום (ד'), בכנס בסן פרנסיסקו, על שני מוצרי תוכנה חדשים מתוצרתה, שיסייעו לחוקרים בתחום הפרוטאומיקס. האחד הוא גרסה חדשה של Z3 - מערכת אוטומאטית לניתוח חלבונים על גבי ג'ל דו-מימדי, והשני הוא "פרוטוקול" - מערכת לזיהוי ואפיון פרוטאינים באמצעות אתר האינטרנט של החברה, שהיא מוצר משלים למוצר הראשון.
הפרדה ואנליזה של תערובות חלבונים מורכבות - הנעשים לרוב באמצעות ג'לים דו-מימדיים - ואחריהם תהליך של זיהוי ואפיון חלבון בודד, הינם שני מרכיבי מפתח בחקר הפרוטאומיקס כיום. פרוטוקול וגירסא 2.0 של Z3 משפרים באופן משמעותי את המחקר בשני תחומים חשובים אלה. פיתוחם יספק כלים ופלטפורמות להאצת חקר מדעי החיים ומיזוג בין המחקר הגנומי והמחקר הפרוטאומי.
לדברי ד"ר זאב סמילנסקי, סגן נשיא לפרוטאומיקס בחברת קומפיוג'ן, הפיתוח מציע לחוקרים בתחום הפרוטאומיקס הזדמנות ייחודית לקשור את נתוני החלבונים שלהם למידע גנומי ולרצפים רלוונטיים ועל ידי כך להוסיף אינפורמציה חשובה למחקר שלהם. לדבריו, פרוטוקול הוא מנוע החיפוש היחיד המאפשר חיפוש מול מאגרי מידע של פרוטאינים, מאגרי מידע של EST ומאגרי מידע גנומי שנמצאים במאגר הציבורי, כמו גם חיפוש מול הפלטפורמה הבלעדית של קומפיוג'ן - LEADS. מאגר הנתונים של קומפיוג'ן כולל ניבוי פרוטאינים חדשים באדם המבוססים על מידע גנומי ועל ביטויים של רצפים גנומיים ומכיל למעלה מ- 70,000 רצפים של גנום האדם, יחד עם החלבונים הנוצרים מהם.
קומפיוג'ן עוסקת בפיתוח ושיווק פלטפורמות, כלים ומוצרים נוספים להאצת המחקר הגנומי והפרוטאומי ולפיתוח תרופות. החברה משלבת גישות מתקדמות מתחומי המתמטיקה והמדעים המדויקים עם ביולוגיה מולקולרית, על מנת לשפר את ההבנה של המחקר הגנומי והפרוטאומי, חקר גנים וחלבונים.
לחברה שיתופי פעולה עם חברות תרופות וביוטכנולוגיה מובילות. החברה גם מספקת לחוקרים בתחום הביולוגיה המולקולרית ולחוקרים נוספים במדעי החיים גישה באמצעות האינטרנט לחלק מהמוצרים והשירותים של החברה, באמצעות האתר האינטרנט של החברה. במעבדה לביולוגיה מולקולרית של החברה גילו כבר למעלה מ - 4000 גנים פוטנציאליים, במטרה להכינם לפיתוח תרופות על ידי שותפים עסקיים.
מרכז המחקר הראשי של קומפיוג'ן ממוקם בתל-אביב ולה משרד בירושלים, חברה בת בבעלות מלאה בניו-ג'רסי ומרכז בעמק הסיליקון, קליפורניה. החברה מעסיקה כ- 180 עובדים, למעלה מ- 120 מהם מתמטיקאים, מהנדסים ומדענים.