בשלב זה לומדים במערכת הביטחון ובלשכת ראש הממשלה את פרטי האירוע. על פי ההערכה הראשונית, מדובר בפיגוע של הג'יהאד האיסלאמי. זאת, בעקבות התרעות מודיעיניות על התארגנות של הג'יהאד האיסלאמי בצפון השומרון לבצע פיגועים בישראל. כמו כן בוחנים את נטילת האחריות של הג'יהאד האסלאמי על הפיגוע.
ראש הממשלה קיבל את ההודעה על הפיגוע דקות ספורות לאחר שסיים את נאומו הכלכלי-חברתי בוועידת העסקים במלון דייויד אינטרקונטיננטל בתל אביב, והיה בדרכו חזרה ללשכתו בירושלים. למרות הפיגוע, תכונס ישיבת סיעת "קדימה" בראשות ראש הממשלה היום בצהריים בכנסת.
שר הביטחון שאול מופז קיבל דיווחים שוטפים ללשכתו בקרייה בתל אביב. השר ביטל את השתתפותו בישיבת סיעת הליכוד וצפוי לערוך אחר הצהריים הערכת מצב מיוחדת על מנת לדון במשמעויות הפיגוע.