יותר משנתיים לאחר שבית הדין הגדול פסק כי יש לבטל אלפי גיורים שביצע הרב חיים דרוקמן בעשור האחרון, ידון הבוקר (ג') בג"ץ בעתירת "מרכז צדק לנשים" ושתיים מהמתגיירות נגד הפסיקה והשלכותיה לגביהן. נשיאת העליון השופטת דורית בייניש והשופטים איילה פרוקצ'ה ואליקים רובינשטיין יידרשו לסוגיה ככל הנראה בפעם האחרונה בתיק זה, אך ההערכה היא כי ההחלטה תינתן במועד מאוחר יותר.
פסיקת בית הדין הגדול, שניתנה בפברואר 2008 על ידי הדיינים הרב אברהם שרמן, הרב חגי איזירר והרב אברהם שינפלד, מתייחסת לגיורים שביצע הרב חיים דרוקמן, לימים ראש מערך הגיור, יחד עם הרב יוסף אביאור, בשבתם בבית הדין המיוחד לגיור במרכז שפירא. היא קובעת כי "כל מעשה הגיורים שעשו הרבנים דרוקמן ואביאור, כולל גיור הקטנים, שנעשו על דעת בית הדין שישב בו הרב אביאור, פסולים ובטלים, משום שבהעדר בית דין כשר הגיור לא תקף".
הדיון בבית הדין הרבני היה בעניינה של רחל (שם בדוי), שהתגיירה 15 שנה קודם לכן, ובשלושת ילדיה, אך ההחלטה שהתקבלה בו מטילה ספק ביהדותם של אלפי גרים נוספים שהתגיירו על ידי שני הרבנים מאז שנת 1999, ובני משפחותיהם. כל אלה עדיין רשומים במשרד הפנים כיהודים ולבית הדין אין סמכות לשנות זאת, אך סירובו להשיא אותם ולהכיר בהם ככאלה הופך את הגיורים לכמעט חסרי משמעות.
היועץ המשפטי לממשלה הסביר את עמדתו בין היתר בכך שלנשים שגיורן הוטל בספק לא ניתנה זכות לטעון את טענותיהן כנדרש. "העותרת לא ידעה בעת הדיון כי שאלת תוקף גיורה עומדת על הפרק וממילא לא הוגשו כל כתבי טענות בעניין זה", נכתב בתשובת המדינה, "לא התקיים דיון סדור בנושא ולא הוצגו ראיות הנוגעות להליך הגיור שעברה העותרת".
כן הובהר כי אין לייחס לפסיקות בית הדין הרבני תוקף כללי כלשהו: "הקביעות והאמירות הכלליות בפסקי הדין, ובכלל זה האמירות המתייחסות לתוקפם של גיורים שנערכו במהלך השנים על-ידי בית הדין בראשות הרב דרוקמן, אינן חלות ביחס לאנשים אשר לא היו צד להליך האמור, והן אינן בעלות תוקף מחייב - לא מבחינה משפטית ולא מבחינה הלכתית - כלפי בתי דין אחרים".
על סירובה לדון עקרונית בסמכותו של בית דין אחד לבטל גיור של בית דין אחר נכתב בתשובת המדינה כי הנחיות שפרסם לאחרונה הרב הראשי שלמה עמאר בנושא מונעות אפשרות זו ולפיכך מייתרות את הצורך להכריע בסוגיה.
ד"ר אביעד הכהן, פרקליטם של העותרים, אמר ל-ynet לקראת הדיון כי "אנו מקווים שבעקבות הדיון יבוא הקץ לסבלם של גרים, שיש המבקשים, ללא כל סמכות שבדין, לבטל גיורם למפרע, תוך הטלת דופי בשמם הטוב ופגיעה בכבודם, בניגוד לערכי היסוד של תורת ישראל המצווה אותנו על אהבת הגר והשמירה על כבוד האדם".