מכון ויצמן יצטייד במחשב על בסביבת לינוקס

מכון ויצמן למדע רכש את מחשב העל 3700 Altix, המבוסס על 60 מעבדי אינטל איטניום 2 הפועלים בסביבת מערכת ההפעלה לינוקס עם 64 ביט. על פי הדיווח, מדובר במחשב העל בסביבת לינוקס הגדול ביותר במזרח התיכון. המחשב ישמש את המחלקה לחומרים ופני שטח של הפקולטה לכימיה במכון, בין היתר, לחיזוי ובחינת תכונות של חומרים שיהוו בסיס לאלקטרוניקת העתיד.
משפחת השרתים והסופר קלאסטרים 3000 Altix SGI, שהוכרזה בחודש ינואר, היא מערכת הלינוקס הראשונה בעולם בעלת יכולות זיכרון גלובלי משותף האופייניות למחשבי-על. המערכת משלבת את ארכיטקטורת המחשבים NUMAflex של SGI ואת המיקרו-מעבד איטניום 2 של אינטל בסביבת לינוקס.
החוקרים ייעזרו ביכולות הזיכרון הגלובלי המשותף ובזיכרון העצום של המערכת (עד חצי טרה-בייט זיכרון - 524,288 מגה בייט), המאפשרת תקשורת מהירה בין המעבדים וגישה של כל מעבד אל כל מרחב הזיכרון.
"אחד הכיוונים המחקריים בהם פועלת המחלקה", אומר ד"ר ליאור קרוניק, חוקר בכיר במחלקה לחומרים ופני שטח, העוסק בחיזוי תכונות חומרים מתוך עקרונות הפיזיקה הקוואנטית, "הוא זיהוי חומרים שישמשו בעתיד בסיס לדורות חדשים של אלקטרוניקה ואשר יפעלו במסגרת עקרונות שונים מאלה המוכרים כיום. האפשרויות במסגרת זו, כוללות אלקטרוניקה המבוססת על חומרים אורגניים, אלקטרוניקה המשלבת תכונות חשמליות ומגנטיות, אלקטרוניקה המבוססת על ננו-טכנולוגיה ועוד".
לדברי ד"ר קרוניק, השימוש במחשב העל בתהליך המחקרי מסייע ליכולת לפרש ועקב כך לחזות התנהגות של חומרים שנמדדו בתנאי מעבדה, לבצע על גבי המחשב, ניסויים שלא ניתן להוציא לפועל בתנאי מעבדה, כדוגמת התנהגות חומרים בתנאים קיצוניים של טמפרטורה או לחץ ולחזות ולהמציא חומרים חדשים, להבין את תכונותיהם ובעקבות זאת להמליץ על ניסיונות לפתח ולייצר אותם. קרוניק הוסיף, כי המשוואות שבבסיס חישובים אלה, סבוכות ביותר וניתן לפתור אותן רק באמצעות מחשב מקבילי חזק.
מחשבי על דומים מותקנים במרכז החישובים הבין-אוניברסיטאי באוניברסיטת תל-אביב, בטכניון ובאוניברסיטת בר-אילן, ומשמשים את חוקרי כל האוניברסיטאות בארץ לניהול מחקרים במדעי הרפואה, ביו-טכנולוגיה, ביו-אינפורמטיקה, אסטרונומיה ואטמוספירה.