המחבלים כיוונו את "חמור הנפץ" באמצעות חוטי תיל וחבל

חקירת הפיגוע של עגלת התופת שהתפוצצה הלילה (יום ג') בצומת נצרים וסריקות שביצעו חיילי חטיבת גולני באזור, מעלה כי המחבלים שלטו בעגלה באמצעות חוטי תיל וחבל, וכך כיוונו את החמור וגרמו לו להיעצר בדיוק בצומת.
לדברי סגן מפקד החטיבה הצפונית ברצועת עזה, סגן אלוף ליאור ליפשיץ, החיילים כי זיהו את העגלה הרתומה לחמור סמוך לשעה 01.30 בלילה, כשעליה דמויות של בני אדם, וחלקה האחורי מכוסה. לאחר שהביטו בעגלה במשך מספר דקות הבינו החיילים כי הדמויות הן בעצם דחלילים שהותקנו על העגלה כדי להטעות וכי היא אינה מאויישת. החיילים אף ירו באוויר לעבר הדמויות. באותו זמן הפעילו המחבלים את המטען בעל המנגנון האלחוטי, והמטען התפוצץ, תוך שהוא מרעיד את חלונות ההתנחלות נצרים, הנמצאת במרחק כמה קילומטרים מן המקום.
מן הפיצוץ נהרג החמור, וגופתו השרופה נותרה בצומת לצד שברים ורסיסים מן העגלה. מן החקירה עולה כי המחבלים התכוונו לפוצץ את המטען בשעה ששיירה ישראלית או כלי רכב של צה"ל יעברו במקום, אלא שבגלל מועד שליחת החמור עם המטען (אחרי אחת בלילה) לא הזדמנה למקום אף שיירה ישראלית, וגם כלי הרכב של צה"ל לא נסעו באותו זמן במקום.
בתגובה לפיצוץ הורה הרמטכ"ל לחטיבה הצפונית ברצועת עזה לחסום את הכביש המרכזי המוביל מהעיר עזה דרומה ועובר בצומת נצרים. כלים הנדסיים של צה"ל חסמו את הכביש (כביש מס'4) בקוביות בטון גדולות ונמנעה תנועת כלי רכב פלסטינים במקום.