ראש הממשלה בנימין נתניהו הגיש תגובה לבג"ץ על העתירות נגד מינויו של רומן גופמן לראש המוסד הבא. בתגובתו טען כי המינוי הינו החלטה ביטחונית המצויה בליבת סמכותו, וכי הביקורת השיפוטית עליה צריכה להיות מצומצמת במיוחד. עוד נכתב כי "יש דווקא סיבה טובה להניח כי סבירות החלטתו של ראש הממשלה עדיפה עשרות מונים על פני ה'סבירות' של כל אחד אחר, ובית המשפט הנכבד בכלל". לפי נתניהו, "האחריות על ביטחון המדינה ואזרחיה מופקדת בידי ראש הממשלה, ורק בידיו".