לשכת ראש הממשלה בנימין נתניהו הגיבה לתחקיר שב"כ על אירועי 7 באוקטובר, ומסרה: "במקום לשתף פעולה עם מבקר המדינה, ראש השב"כ רונן בר מציג 'תחקיר' שלא עונה על אף שאלה". לדבריה, "מסקנות התחקיר לא הולמות את גודל הכשל והמחדל של הארגון והעומד בראשו. ראש השב"כ כשל בכל הקשור להתמודדות של הארגון נגד חמאס בכלל, ובאירועי 7 באוקטובר בפרט". מהלשכה נמסר כי "בנוסף לכל, ראש השב"כ לא ראה לנכון להעיר בליל המתקפה את ראש הממשלה - ההחלטה הבסיסית והמתבקשת ביותר".