מאז פרצה המלחמה ב-7 באוקטובר 2023 זינק מספר האסירים הביטחוניים בכ-92%, אבל צה"ל ושב"ס לא נערכו כנדרש לתרחיש של מאסרים לטווח ארוך. כך קבע דוח מבקר המדינה העוסק בכליאה, שחרור והעמדה לדין של אסירים ביטחוניים בעקבות "חרבות ברזל". הדוח מפרט את ההשלכות של הכשל, אחת מהן נוגעת לשחרור 19 אסירים, בהם מנהל בית החולים שיפא בעזה: "יש לראות בחומרה את העובדה שהשחרור של כלואים שנשקף מהם סיכון לביטחון המדינה לא הובא בזמן אמת לידיעת ראש הממשלה". המבקר קבע כי הכשל פגע ביכולת שב"כ לבצע מעצרים וחקירות, לצד הגברת העומס והסיכון על סגל שב"ס.