כוחות צה"ל פתחו במבצע "מגן ירושלים", במטרה לפעול נגד תשתיות הטרור באזור הכפרים קטנה וקובייבה מהם יצאו המחבלים שביצעו את הפיגוע בצומת רמות בירושלים. במהלך המבצע, הכוחות כיתרו כפרים, מיפו את שני בתי המחבלים שביצעו את הפיגוע, עצרו יותר מ-20 מבוקשים החשודים בפעילויות טרור, סרקו יותר מ-700 יעדים והחרימו 38 אמצעי לחימה, חלקי נשק, מחסניות, דגלי דאעש וציוד צבאי נוסף. כמו כן, בכפרים קובייבה ואל-מועייר, מהם יצאו מחבלים לאחרונה, נהרסו על-ידי המינהל האזרחי רכיבי בינוי שהוקמו בניגוד לחוק.