בפנייה רשמית לנציב שירות המדינה דורון כהן, טוען "מרכז יכין" למחקרים אסטרטגיים לאומיים כי הנוהל החדש לטיפול בתלונות על גזענות ואפליה מרחיב סמכויות ללא בסיס חוקי, שולל את שיקול הדעת ממנהלי משרדי הממשלה ובתי החולים, ויוצר מנגנון בירוקרטי כפול הפוגע במנהל התקין. המרכז דרש מדורון להקפיא באופן מיידי את יישום ההנחיה העוסקת בטיפול בתלונות בתחום הגזענות והאפליה. נטען כי ההנחיה חורגת מסמכות הנציב ופוגעת בעקרונות יסוד של שלטון החוק.