מבקר המדינה מתניהו אנגלמן פרסם דוח ביקורת בנוגע לתיאום בין המערכת הממשלתית לבין גופים תורמים והתנדבותיים במהלך מלחמת חרבות ברזל, וציין כי עלו פערים בהיערכות המשרדים ובהיעדר גוף מתכלל. בדוח נכתב כי "היקף כוח האדם הדל שיועד ליחידה למול גודל האחריות והמשימה שהממשלה הטילה עליה - בייחוד בהתחשב בהיקפים הגדולים של פעילות התרומה וההתנדבות בישראל בשגרה ובחירום, ששוויה הכספי הסתכם בשלושת החודשים הראשונים של מלחמת חרבות ברזל בכ-14.78 מיליארדי ש"ח - מחייבים בחינה אם המשאבים שהועמדו לרשות היחידה בשגרה (לפני פרוץ המלחמה) ובמהלך המלחמה, היו בהלימה לייעודה". עוד צוין כי בשבעה מ-15 ממשרדי הממשלה שקיימו קשר עם גופים תורמים והתנדבותיים במלחמה (כ-47%), לא היה בעל תפקיד אחראי לקשר בעתות שגרה וחירום.