לוחמים מיחידת דובדבן זיהו כוח אחר של היחידה כאויב חמוש על גג מבנה בקסבה של שכם ופתחו לעברו באש. לא היו נפגעים באירוע שהתרחש בשבוע שעבר, אך ביחידה החליטו להדיח כמה מפקדים ביחידה עם קשר ישיר לפעילות - ובמקביל נרשמו הערות פיקודיות לאחרים.
אלה העונשים שניתנו למפקדים והלוחמים: מפקד צוות יודח מתפקידו; סמל צוות שהשתתף בפעילות וירה בניגוד להוראות הפתיחה באש יודח מתפקידו; סגן מפקד היחידה יקבל הערה פיקודית על-ידי מפקד האוגדה; מפקד הפלגה יקבל הערה פיקודית על-ידי מפקד החטיבה; סגן מפקד הפלגה יקבל הערה פיקודית על-ידי מפקד היחידה; מפקד צוות בפלגה יקבל הערה פיקודית על-ידי מפקד היחידה; ולוחם יקבל הערה פיקודית על-ידי מפקד היחידה.
על פי הודעת צה"ל, במהלך הפעילות נעצרו שני מבוקשים החשודים בפעולות טרור. לאחר התקרית, שדווחה בזמן אמת, בוצע תחקור מיידי בשטח ובצירים הפיקודיים, עד להצגתו למפקד פיקוד המרכז, אלוף אבי בלוט. התחקיר בחן את איכות התכנון והוצאת המבצע לפועל, וכן את ניהול הפעילות.
מהתחקיר עלה כי בעקבות טעות בניווט, כוח הלוחמים שהתמקם בשוגג במבנה שנמצא בגזרת פלגה שכנה שפעלה במבצע זוהה כאויב. "בשום שלב הלוחמים לא היו בין כוונות היורים וכי לא הופעלו אמצעי תקיפה נוספים מעבר לירי למרחב המבנה", נאמר בהודעת צה"ל.
מפקד פיקוד המרכז בלוט אמר כי "מדובר באירוע ירי דו-צדדי חמור ביותר שיכול היה לעלות בחיי אדם".
