מפקדת אוגדה 98 תופעל באזור יהודה ושומרון ותפקד על חטיבות יהודה ועציון, כך הנחה הרמטכ"ל רא"ל אייל זמיר. בהודעת דובר צה"ל נמסר כי "הפעלת מפקדת האוגדה באזור מהווה מרכיב בחיזוק הפיקוד והשליטה, על מנת להגביר את יכולות ההגנה וההתקפה ביהודה ושומרון. זאת על רקע האירועים האחרונים, והרצון להגביר את הביטחון בתקופה מתוחה זו". מדובר באירוע משמעותי שלא היה כמוהו בשנים האחרונות.