מערכת הביטחון דרוכה עד הקצה כדי למנוע הסלמה ביטחונית, על רקע רצף הפיגועים האחרון. בין השאר, תוגברו הכוחות ביהודה ושומרון - שם מוצבים כ-24 גדודים שעיקר משימתם תהיה הגנה על קו התפר למניעת הסתננות מחבלים, וכמובן הגנה על הצירים והיישובים. גם המשטרה השלימה את היערכותה ליום הכיפורים, ותתגבר את הסיורים במרכזי הערים ובמוקדים רגישים. במשטרה קראו לאזרחים בעלי רישיון נשק לשאת אותו עימם גם במהלך התפילות בבתי הכנסת. בנוסף, סמוך לכניסת החג הוצבו בטונדות בכניסות לשכונות ערביות בירושלים, במטרה למנוע חיכוכים ועימותים. המחסומים יוסרו עם צאת החג.