רכבת שנסעה באזור שפיים פגעה ברכב שפרץ את המחסום - ובעקבות התאונה הופסקה התנועה בין התחנות הרצליה ונתניה. בעקבות התאונה מורגשים שיבושים בתנועת הרכבות, ונוסעים מורדים בתחנות שונות עד לפינוי המסילה. ברכבת ציינו כי הוזמנו שאטלים לטובת הנוסעים, אך הגעתם עלולה להתעכב.
כוחות הצלה הוזעקו לאזור התאונה. ברכבת ציינו כי לא היו נפגעים בקרב נוסעי הרכבת, ובמגן דוד אדום עדכנו כי נהג הרכב אותר ללא רוח חיים. הפרמדיקית שובל גולן והחובש אבי דהרי ממד"א דיווחו כי "כשהגענו למקום ראינו את הרכב הפרטי עם פגיעה קשות מאוד בסמוך למסילה. נהג הרכב, גבר בן 43 שכב כשהוא מחוסר הכרה וסובל מפגיעה רב מערכתית קשה מאוד. ביצענו בדיקות רפואיות, הוא היה ללא סימני חיים ולא נותר לנו אלא לקבוע את מותו".
מעוז יינון, שהיה על הרכבת הפוגעת, אמר כי "תנועת הרכבות דרומה הופסקה, ויש רק קו אוטובוס אחד לתל אביב, שזו הדרך היחידה מפה למרכז". יינון הדגיש כי מדי כמה חודשים מתרחשות תאונות באזור בית יהושע, בין אם עם מכוניות או בני אדם: "זו נקודת כשל של הרכבת שלא מצאו פתרון למקרים האלה. יש פה 200 בני אדם שמחכים".