בג"ץ קבע כי אין עילה להתערבות שיפוטית בחוות דעתה של יועמ"שית משרד המשפטים שלפיה פרקליט המדינה אינו מנוע עוד מלעסוק בליווי חקירת פרשת הפרקליטה הצבאית הראשית, וכי אין עילה לתת לשר המשפטים שהות נוספת לשימוש בסמכותו למנות מפקח אחר על החקירה. במקביל, השופט דוד מינץ סבר בדעת מיעוט כי יש להוציא צו על תנאי המורה לשר המשפטים לנמק מדוע לא יפעל למינוי גורם מפקח לחקירה.