במהלך חקירתו הנגדית בתיק 2000, אמר ראש הממשלה בנימין נתניהו כי ראה ב"ידיעות אחרונות" "גוף תקשורת עוין". לדבריו, "הוא היה עוין למדיניות שהובלתי מהרגע שנבחרתי".