ארבעה פרופסורים התפטרו מהמועצה להשכלה גבוהה בעקבות אישור חוק ההפרדה המגדרית באקדמיה. פרופ' מרסל מחלוף מהטכניון; פרופ' ג'יהאד אל־צאנע מאוניברסיטת בן-גוריון; פרופ' ליה לאור מהמרכז האקדמי לוינסקי-וינגייט; ופרופ' עידית תשובה מהאוניברסיטה העברית מירושלים, מסרו: "הישגיה של מדינת ישראל בתחומי המדע, הטכנולוגיה, והרפואה נשענים על מערכת השכלה גבוהה עצמאית, פתוחה, שוויונית. פגיעה בעצמאותה של המערכת ובערכיה אינה פגיעה באקדמיה בלבד. היא מערערת את חוסנה של המדינה". במכתב נפרד הודיע על התפטרותו מהמל"ג גם מנכ"ל המועצה לשעבר, משה ויגדור.