משרד הבריאות מותח ביקורת חריפה על הדוח שהגיש מבקר המדינה מתניהו אנגלמן על מה שהגדיר כ"קריסת מערך בריאות הנפש לאחר 7 באוקטובר". לפי המשרד, "הדוח שגוי מיסודו וחסר יכולת לנבא את היקף הפונים לטיפול נפשי וכשלעצמו עלול גם לגרום לנזק של ממש ולגרום לפתולוגיזציה ותחושת חוסר אונים נפשי בציבור הרחב". עוד נמסר כי "אנו מודעים לכך שהמערכת אינה מושלמת".