משרד החוץ הגיב על טענותיהם של פעילי המשט לעזה שנעצרו והועברו לישראל, שלפיהן הם עברו עינויים והוכו. "בניגוד לטענות הכוזבות וחסרות הבסיס שהוכנו מראש, בשום שלב לא עברו עינויים סייף אבו קשק ותיאגו אבילה. בעקבות חסימה פיזית אלימה נגד אנשי צוות ישראלים, הצוות נאלץ לפעול על מנת להפסיק את הפעולות הללו", נמסר. "במהלך תהליך העברת הנוסעים לכוחות היווניים, מספר נוסעים סירבו והחלו להתפרע באלימות. על מנת לטפל באלימות ולהשלים את ההעברה, יחידת שיטור שפעלה על סיפון כלי שיט של צה"ל נאלצה להשתמש בכוח".