שעות רבות אחרי הפיגוע אתמול בבוקר ליד צומת נבי אליאס שבשומרון, נמשך המצוד בעקבות המחבל שפתח באש על כלי רכב בכביש 55 ופצע שני בני אדם – חיילת בת 19 שמצבה קשה מאוד, וגבר כבן 50 שמצבו קל עד בינוני. מאוחר יותר נוטרל ברכבו של המחבל מטען חבלה.
המחבל הגיע ככל הנראה מאזור הכפר נבי אליאס בכלי רכב בעל לוחית זיהוי צהובה. הוא נסע בציר עפר ליד כביש 55, וחנה בסמוך. לאחר מכן פרק רגלית ואז ביצע את הירי מהשוליים. בהמשך נמלט רגלית, ורכבו נותר בזירה.
כוחות גדולים של צה"ל הוזעקו למקום ופתחו במצוד שבמסגרתו גם הוזנק לאוויר כטב"ם. הכוחות כיתרו את נבי אליאס וערכו חסימות באזור קלקיליה הסמוכה. נמצא רובה תקני מסוג אם-16 שלפי החשד שימש את המפגע.
המחבל, שארב כאמור לכלי רכב על הכביש, גרם נזק כבד לאוטובוס שבו הייתה החיילת: דלת הכניסה הקדמית שלו נופצה לגמרי, וקליעים פגעו גם בשמשה הקדמית ובחלונות הנוסעים. בתמונות מתוך האוטובוס נראים גם מושבי הנוסעים שנפגעו מהירי. קליע אחד חדר את הזכוכית שמאחורי ראש הנהג, שנפגע מרסיסי זכוכית. החיילת פונתה לבית החולים בילינסון, שם עידכנו שנשקפת סכנה לחייה.
המחבל ירה גם לעבר מכונית פרטית, שבה נפצע גבר כבן 50 שמצבו קל-בינוני.
תושב קרני שומרון, שמוליק, שנסע במקום העיד כי המחבל ירה גם על מכוניתו: "ראיתי שהוא מוציא אם-16 ויורה עליי. התכופפתי תוך כדי נסיעה, עצרתי, ראיתי שהוא מחליף מחסנית – והתחלתי לרוץ לכיוון שלו. הוא ראה שאני רץ אחריו, השאיר את האוטו שלו דלוק, עם טלפון באוטו – והתחיל לברוח לכיוון קלקיליה".
שמוליק ציין כי רכבו ספג שתי פגיעות מהירי, בדלת הקדמית ובחלון הקדמי. הוא עצמו לא נפגע.