פחות מחצי יממה אחרי תחילת הפעולה במזרח רפיח, השתלטו חטיבות גבעתי ו-401 על מעבר רפיח העזתי - 3.5 ק"מ מגבול ישראל. בתיעוד שפורסם נראה כלי צבאי דורס את השלט "עזה" במעבר. חיל האוויר תקף יותר מ-100 מטרות באזור רפיח, לפחות 20 מחבלים חוסלו ושלושה פירי לחימה אותרו.
מעבר רפיח נותק על ידי צה"ל מכביש סלאח א-דין, ציר האורך המרכזי ברצועה. חטיבת גבעתי שולטת מרכס דהניה על המעבר. מכונית תופת שהתקדמה לעבר הכוחות הושמדה.
דובר מעבר רפיח, ואיל אבו עומר, אמר כי "תנועת הנוסעים וכניסת הסיוע לרצועת עזה הופסקו לחלוטין, לאחר שטנקים ישראליים נכנסו למתקני המעבר מהצד הפלסטיני". מנגד אמרו בצה"ל כי המאמץ ההומניטרי להכנסת סיוע לרצועה יימשך והסיוע ייכנס בכמה דרכים ומעברים.
מזכ"ל האו"ם אנטוניו גוטרש הגיב למבצע ברפיח: "אני שב ומדגיש את קריאתי הן לממשלת ישראל והן להנהגת חמאס לעשות את הקילומטר הנוסף הדרוש כדי להגשים הסכם ולהפסיק את הסבל הנוכחי. אני מודאג מאוד מכך שמבצע צבאי רחב היקף ברפיח עשוי להיות בפתח".
