חקירת המשטרה נגד קצין המשטרה הבכיר, שמפקד על אחת היחידות הרגישות ביותר של מחוז ש"י, נוגעת ‑ לפי החשד ‑ להדלפת מידע מסווג לשר לביטחון לאומי איתמר בן גביר, שבתמורה הבטיח לו קידום. ברקע הדברים, ניכרת התנהלות לא מקצועית לכאורה במחוז בכל הנוגע לטיפול בפשיעה הלאומנית ביהודה ושומרון. בתחקיר "7 ימים" של "ידיעות אחרונות" מחודש יוני, נחשפו קשיים בהתנהלות בין שב"כ למשטרת המחוז. כך לדוגמה, פורסם בתחקיר כי באותה עת, מתוך 15 בקשות של שב"כ מהמשטרה לטיפול ב"יעדים" יהודים - רק בשלוש פעלה המשטרה.
השינוי במדיניות במחוז ש"י היה משמעותי במציאות שבה התרבו אירועים אלימים שהסתיימו ללא מעצרים – וגם כתבי אישום בקושי הוגשו נגד פורעים בהתנחלויות. בנוסף, דלות הראיות שנאספו בידי השוטרים בשטח הובילה את שב"כ וצה"ל להשתמש בצווי מעצר מינהליים - שאותם בינתיים כבר ביטל שר הביטחון ישראל כ"ץ.
גופי חקירה מקבילים, בהם שב"כ וצה"ל, מסבירים כי בנושאים מסוימים ישנו קושי משמעותי בפענוח תיקי חקירה וכי רוח המפקד של בן גביר מנשבת במסדרונות המחוז והקצינים פועלים בהתאם. ב"ידיעות אחרונות" פורסמו מספר מקרים בעבר שלפיהם בחקירות, בעיקר של פשיעה לאומנית, המשטרה לא עובדת עם השב"כ באופן שוטף. בנוסף, לטענת גורמי ביטחון, השר בן גביר מדבר ישירות עם קצינים מבלי לעבור דרך מפקד המחוז בנוגע לנושאים שונים על סדר היום. בחלק מהמקרים, גורמים במערכת הביטחון היו "המומים", כהגדרתם, אחרי שראו כיצד מתנהלות חקירות וכיצד מתנהלים החוקרים בחקירות. "המדיניות", כפי שקורא לה השר בן גביר, גרמה למתחים וליחסי עבודה עכורים בין הגופים השונים, שהגיעו עד כדי הסתרת מידע אחד מהשני. גם אלוף פיקוד המרכז הקודם יהודה פוקס דיבר על כך מספר פעמים ואף התעמת עם קצינים במחוז בנוכחות ראש הממשלה בנוגע לחקירות פשיעה לאומנית.
מפקד מחוז ש"י הקודם, ניצב עוזי לוי, התריע בפני קציניו מספר פעמים שלא ידברו ישירות עם השר בן גביר מבלי לדווח לו או לעבור דרכו, אך הדבר לא קרה. למעשה, בן גביר, שרצה לקדם שינוי מבחינתו בגישה של המשטרה בחקירות פשיעה לאומנית, קידם מדיניות ברוח זו וקצינים במחוז יישרו עימו קו.
