ראש הממשלה בנימין נתניהו הגיש אמש את תגובתו לצו הארעי שהוציאה בסוף השבוע שופטת העליון גילה כנפי-שטייניץ, שלפיו יוקפאו פיטוריו של ראש השב"כ רונן בר עד להחלטה נוספת בנושא. לדבריו, "הסוגיה אינה שפיטה, הסמכות לפיטורי שב"כ נתונה לרה"מ ולממשלה. בר בחר לוותר על הופעתו בפני הממשלה, מכתב בר לשרים כמוהו כמכתב התפטרות".
התגובה הוגשה באמצעות עו"ד ציון אמיר, אשר מייצג את הממשלה לאור חילוקי הדעות בנושא בין הממשלה ליועמ"שית. בתגובה נכתב בין השאר: "המשיבים מתנגדים באופן נחרץ לבקשה, אשר הלכה למעשה, מבקשת להפקיע מידי המשיבים את סמכותם, חובתם ואחריותם כרשות המבצעת”.
היועמ”שית מצידה מסרה לבג”ץ כי היא מבקשת להשיב לצו רק בשלב הגשת התגובה לגוף העתירות, וזאת מפני שלא סיימה את הבירור העובדתי בנוגע לסוגיית ניגוד העניינים: “כפי שנמסר לרה”מ טרם כינוס הדיון בממשלה, התעוררה שאלה האם בנסיבות העניין כלל יש באפשרותו של רה”מ, יוזם החלטת הממשלה מושא העתירות, לעסוק בנושא סיום כהונת ראש השב”כ ומינוי ראש שירות חדש, במקביל לקיומן של שתי חקירות פליליות הנוגעות לגורמים הקשורים ללשכתו ביחס לעניינים הנוגעים לעבודה בלשכתו”, כתבה בהרב-מיארה.
בהמשך ציינה: “ניתן לומר כבר בשלב זה, כי החלטת הממשלה לוקה בפגמים מהותיים היורדים לשורשה של הפעולה המנהלית, וזאת הן ביחס להליך קבלת ההחלטה, הן ביחס לשיקול הדעת שהופעל במסגרת קבלת ההחלטה, כעולה גם ממכתבי היועמ”שית שצורפו כנספחים לעתירות ומחוות הדעת שהציגה בפני הממשלה במהלך ישיבתה”. בסיום מכתבה ביקשה מבג”ץ להאריך את הצו הארעי שמשמר את המצב הקיים עד לדיון שנקבע ל-8 באפריל.