המתקפה המרוכזת על בסיסי הכוח של משטר האייתוללות באיראן מהווה שינוי כיוון. אם בתחילת המלחמה ישראל הצהירה שבכוונתה לתקוף את תוכנית הגרעין, כעת כבר ברור שהמתקפה היא לא רק על הגרעין אלא גם על המשטר. בהתחלת המערכה צה"ל תקף סמלי שלטון, אבל כעת הוא תוקף את השלטון עצמו ואת הגופים הביטחוניים שתפקידם הוא לשמור על שרידותו. היעדים: משמרות המהפכה, מנגנוני ביטחון הפנים שלהם וגם מפקדות הבסיג'. המטרה: להחליש ולערער את הגופים שדיכאו ומדכאים התקוממויות ברפובליקה האיסלאמית, כדי לאפשר למתנגדי המשטר בתוך איראן להתקומם בהצלחה.
המטרה הנוספת של התקיפות היא ליצור משוואה מול המשטר - אם הוא ימשיך לשגר טילים לעבר אזרחים ישראלים, ישראל תפגע בדבר הכי חשוב לו - השרידות. משמרות המהפכה, כארגון, כשמו כן הוא - נועד לשמור על שלטון האייתוללות, ולהפיץ את המהפכה האיסלאמית ברחבי איראן והמזרח התיכון. הם גם אלה שמפעילים כמיליון אזרחים הפעילים במיליציות הבסיג' שלא היססו לטבוח באזרחי הרפובליקה האיסלאמית במסגרת דיכוי גלי המחאה בשנים האחרונות.
מומחים וכן החתום מעלה מעריכים כי ההתקוממות באיראן, אם תגיע, לא תתרחש מיד. נכון שיש גורמי אופוזיציה, ואפילו קבוצות חמושות, שמחכים להתקומם נגד משטר האייתוללות - ביניהם המוג'אהדין חאלק - אבל ההערכה היא שאם זה יקרה, זה יהיה רק אחרי שתיגמר המערכה הצבאית עם ישראל. הסיבה היא שכל עוד ההתקפות הישראליות נמשכות, ההמונים מפחדים לצאת לרחובות, אם בגלל ההפצצות ואם מפני שהשלטון מציף את הערים הגדולות באנשי משמרות המהפכה והבסיג’ שמוכנים לדכא באכזריות כל גילוי של התקוממות. גם תומכי המשטר - ויש רבים כאלה - מתלכדים כעת סביבו. לכן אם תהיה התקוממות, זה יקרה רק כשאנשי האופוזיציה יוכלו לצאת מהבתים, לתקשר ביניהם באינטרנט ולהתאגד כדי לפעול.
במקביל, תקיפת מתקני השלטון ובסיסי הכוח שלו נועדה להגביר את הלחץ על המשטר האיראני, לקראת סגירה של המלחמה באמצעות הסכם שיהיה קביל גם בירושלים. בהקשר זה, הפצצת הכניסה לכלא אווין מטיל האימה היא משמעותית: לא מפציצים את הכלא כדי לא להרוג אסירים שכלואים בו, אבל פוגעים בשומרים, כדי לעודד בריחה. בנוסף, יש לשים לב שהמתקפה על כלבי השמירה של משטר האייתוללות מתקיימת בעיקר באזור טהרן והעורף התעשייתי שלה - כלומר, איום ישיר וקרוב על המשטר.
אך למרות שההתקוממות כנראה שאינה קרובה, יש אפשרות שהפגיעה ביציבות המשטר תאפשר למתנגדיו לפעול ספונטנית בסיום המלחמה, או זמן מה אחריה. קיימת אפשרות שהפגיעה בשלטון האיראני תביא למלחמת אזרחים ברפובליקה האיסלאמית, כיוון שיש לא מעט קבוצות חמושות שמחכות להזדמנות.
