משרד האוצר מציע לצמצם באופן משמעותי את הטבת המס בקרנות ההשתלמות, אפיק ההשקעה ארוך הטווח היחיד שקיים למעשה שאין משולמים עליו מסים. הצעות לאורך השנים של משרד האוצר לבטל את ההטבות כבר גרמו בעבר להתנגדות בלתי מתפשרת מצד ההסתדרות ואף להשבתת המשק.
על פי הצעת הכלכלן הראשי במשרד האוצר, ד"ר שמואל אברמזון, מומלץ לצמצם באופן משמעותי את הטבת המס בקרנות ההשתלמות, עם עדיפות להפחתת תקרת ההכנסה המזכה בהפקדה. צעד כזה יאפשר לדברי הכלכלן הראשי את הפחתת שיעורי המס באופן שקוף יותר ובמסגרת זו גם יאפשר לשפר את הפרוגרסיביות של מערכת המס בישראל.
ד"ר אברמזון מציין כי צמצום ההטבות בקרנות ההשתלמות יכול יהיה לשמש גם לצמצום החוב הציבורי או לקידום הוצאה ציבורית תומכת צמיחה ורווחה. עוד טוען הכלכלן הראשי כי ככל שקיים צורך בעידוד ממשלתי לחיסכון של משקי הבית לטווח בינוני, עדיפה החלפתן של הקרנות בכלי אחר, שוויוני ונגיש לאוכלוסייה באופן רוחבי.
יצוין כי בשנת 2024 הסתכמה ההוצאה התקציבית, כתוצאה מהפסד הכנסות ממסים, כולל הפרשות לביטוח הלאומי בגין הטבות המס בקרנות ההשתלמות ב-10.7 מיליארד שקל, מתוכן 8.5 מיליארד שקל בגין הטבה בעת ההפקדה וכ-2.2 מיליארד שקל בגין הטבת הפטור ממס רווחי הון בעת משיכת הכסף מהקרן.
47% מהשכירים בישראל בגילי 64-25 מפקידים כספים לקרן ההשתלמות ונהנים מהטבת המס הייחודית, כאשר ברמות ההכנסה הגבוהות ובעלי ההשכלה הגבוהה, שיעורי ההפקדה גבוהים יותר באופן משמעותי. עוד מתברר כי רק 9% מהעובדים בעשירון התחתון בישראל מפקידים כספים לקרנות ההשתלמות, בהשוואה ל-83% מהעובדים בעשירון העליון. שיעורי הזכאות להטבה נמוכים במיוחד בקרב עובדים ללא השכלה גבוהה, רק 33%, המגזר החרדי, 26%, והמגזר הערבי, 16%. כמו כן ההפקדות נמוכות במיוחד בענפי החקלאות, המסחר, הבינוי, האירוח והאוכל.