הגילויים החדשים במסמכים ובהקלטות שפורסמו לגבי אפשטיין לא פסחו על ראש הממשלה לשעבר אהוד ברק.
ברק, כך עולה מהמסמכים, נהג לשהות בדירה השייכת לאפשטיין בניו-יורק — לעיתים לפרקי זמן ארוכים. במסמכים ישנן התכתבויות רבות של עובדיו של אפשטיין בהן הם מזכירים את דירה 11J כדירה של ברק ורעייתו נילי פריאל. בהודעה האחרונה בהקשר זה, פריאל הודיעה לעובדיו של אפשטיין כי היא וברק יגיעו לדירה ב-21 ביוני 2019, שבועיים לפני מעצרו של איל ההון בחשד לעבירות פדופיליה וניהול רשת סחר בקטינות. חודש לפני כן, העוזרת האישית של אפשטיין, לסלי גריף, הודיעה לפריאל כי 24 ארגזים שלה ושל ברק הועברו אל הדירה.
כמו כן נחשפה הקלטה באורך של כשלוש שעות וחצי משיחה שקיים ברק ב-2013 עם אפשטיין ושר האוצר האמריקאי לשעבר לארי סאמרס. השיחה עסקה בנושאים עסקיים, אך במהלכה חשף ברק דעות מטרידות. "אנחנו יכולים לקלוט עוד מיליון בקלות", אמר ברק, "פעם הייתי אומר לפוטין שאנחנו צריכים רק עוד מיליון אחד, מיליון רוסים שיכולים לשנות את ישראל דרמטית. הרבה בנות צעירות ויפות יגיעו, גבוהות ורזות". בשיחה ברק הזהיר כי ישראל נמצאת "במדרון חלקלק" למדינה אחת עם רוב ערבי, והוסיף כי כדי לפתור זאת יש להפסיק את המונופול של הרבנות על נישואים, קבורה וגיורים. הוא הדגיש: "אנחנו יכולים לשלוט באיכות העולים, לא כמו אבותינו שהביאו אנשים מצפון אפריקה ומדינות ערב, כל מי שיכול היה להגיע. אנחנו יכולים להיות בררנים".
הקשר בין אפשטיין לברק היה ידוע, וברק הודה כי ביקר בבתיו לא פעם, אך לדבריו מעולם לא נכח במסיבות שאפשטיין ערך. לאחר התאבדותו של אפשטיין בתאו, ברק טען: "הייתי מעדיף שהקשר בינינו לא היה נוצר".
בינואר 2014, שש שנים לאחר הרשעת אפשטיין, ברק שלח לו ברכת יום הולדת. "אני גאה לקרוא לך חבר שלי... כל טוב - גם מנילי. מצפה לראותך, אהוד ברק".
