החלטת האו"ם לצרף רשויות בישראל לרשימה השחורה של מבצעי אלימות מינית חמורה, לכאורה כלפי עצורים פלסטינים — לצד ארגוני טרור כמו דאעש, אל-קאעידה וחמאס — מעלה שורת שאלות מטרידות.
לצד הנזק התדמיתי והפוליטי, נשאלת השאלה: האם לוחמי צה"ל, שב"ס והימ"מ מסתכנים כעת במעצרים ותביעות בחו"ל? האם מדובר בתמרור אזהרה משפטי שעלול להשפיע גם על בית הדין בהאג? והאם יושפעו שיתופי פעולה ביטחוניים וחופש הפעולה של ישראל בעולם?
אל”מ (במיל') ד"ר ערן שמיר-בורר, מנהל המרכז לביטחון לאומי ודמוקרטיה במכון הישראלי לדמוקרטיה, כיהן בעבר כראש המחלקה לדין בינלאומי בפרקליטות הצבאית. לדבריו, ההשלכות הישירות הנובעות מן הדוח הן בעיקר במישור הציבורי, התקשורתי והדיפלומטי: "יש פה פגיעה בלגיטימציה ובדימוי של מדינת ישראל ושל גופי הביטחון שלה, הנובעים מכך שמופנות כלפיהם האשמות חמורות מאוד, ומעצם כך שאנחנו מופיעים באותה 'רשימה שחורה' לצד ארגוני טרור ומדינות לא-דמוקרטיות, שאנחנו לא רוצים להשתייך לאותו מועדון איתן".
הוא מוסיף כי "לדוח עלולות גם להיות השלכות עקיפות חמורות יותר. למשל, הוא עלול לסייע לדרום-אפריקה בתיק הג'נוסייד שהיא מנהלת נגד ישראל בבית הדין הבינלאומי לצדק בהאג, וכולל טענות בעניין היחס של ישראל לעצירים פלסטינים. הוא עלול גם לפגוע בשיתוף הפעולה הביטחוני והמודיעיני של ישראל עם מדינות בעלות ברית. הוא עלול לתת רוח גבית לסנקציות שמדינות שונות מקדמות נגד גורמים ישראליים. והוא עלול גם בהמשך להשפיע על החקירה הפלילית המתנהלת בבית הדין הפלילי הבינלאומי בהאג, ולהעלות את הסיכון לצווי מעצר של בית הדין".
עם זאת, לטענתו אין סכנה לצווי מעצר נגד חיילי צה"ל: "'הרשימה השחורה' שבדוח מתייחסת לא רק לצה"ל אלא באופן כללי יותר לכוחות הביטחון הישראליים, ויש להניח שגם לשב"ס ולימ"מ, על רקע טענות למעשים במתקני כליאה, מתקני מעצר ובתחנות משטרה. "לא נראה שהמשרתים בגופים אלה נמצאים בסיכון לצווי מעצר או הליכים משפטיים. כדי לבסס עילה לצו מעצר צריך לגבש ראיות מספקות שהאדם היה מעורב באופן אישי בביצוע עבירות, או שהייתה לו אחריות פיקודית לכך".
לדברי עו"ד יובל ששון, מומחה למשפט בינלאומי ושותף במשרד עו"ד מיתר, עצם ההשוואה בין ישראל לארגוני טרור היא מקוממת. "אין שום ראיות לדברים האלה. זה ניסיון מעושה לרצות את הפוליטיקה העולמית וזה מה שהאו"ם מנסה לעשות". לדבריו, דוחות מסוג זה עלולים להשפיע על ישראל ואפשר להשתמש בהם נגדנו: "כבר ראינו שהשתמשו בזה להוציא צווי מעצר נגד ראש הממשלה ושר הביטחון לשעבר".
גם ששון טוען כי מדינה שתוציא צווי מעצר נגד חיילים, תצטרך להוכיח שיש הצדקה לכך: "מדינה שמוציאה צו מעצר נגד חייל צריכה להוכיח שהוא ביצע את פשע המין או שהייתה לו אחריות פיקודית על לוחמים שביצעו את הפשע".
