אחרי חשיפת "ידיעות אחרונות" על חילוקי הדעות בין החשבת הכללית במשרד האוצר מיכל עבאדי-בויאנג'ו לבין הרמטכ"ל רב-אלוף אייל זמיר בעניין התגמולים הכספיים לפצ"רת המודחת, יפעת תומר-ירושלמי, התחוללה סערה. שר הביטחון ישראל כ"ץ נזף ברמטכ"ל ודרש ממנו להחמיר עם הפצ"רית, אך המחלוקת הגדולה בין הרמטכ"ל לחשכ"לית נעוצה בעצם בשאלה – מי מחליט?
יותר משעסקו מכתביו של ראש אגף כוח אדם בצה"ל לחשכ"לית, שנכתבו במעורבות הפרקליטות הצבאית, בתנאי ההדחה של הפצ"רית – הם טענו לסמכותו הבלעדית של הרמטכ"ל להחליט עליהם. כך גם לגבי מכתבה של החשכ"לית, שבו ציינה את המקורות החוקיים ואת פסיקת בג"ץ בנוגע לסמכותה שלה לקבוע. היא אף כתבה כי בתחילה צה"ל לא עירב בכלל את חשב הצבא.
לטענת הרמטכ"ל, משההחלטה הפיקודית להדחת הפצ"רית נתונה לו וניתנה על ידו, הרי שכך גם תנאיה הכספיים של ההדחה – אותם קבע, כך עולה ממכתבה של החשבת, לאחר פגישה שערך עם עורכי דינה של הפצ"רית.
החשכ"לית, לעומת זאת, סוברת כי אכן ההחלטה הפיקודית ואף תנאיה הכספיים מסורים לרמטכ"ל, אלא שהחלטות הרמטכ"ל כפופות לדין ועליהן להתקבל בסבירות ותוך שיקלול כל הנתונים בהתאם לכללי המשפט המנהלי. כפי שהחשב הכללי התקבל כשומר סף על הממשלה ורשויות מדינה אחרות, כך גם בנוגע לצה"ל והחלטות הרמטכ"ל אשר עליהן להיבחן מקצועית על ידי החשב.
בדרך כלל כאשר מתקיים מאבק סמכויות בין גופי מדינה, מי שמכריע הוא הייעוץ המשפטי לממשלה. היועמ"שית גלי בהרב-מיארה מנועה מלעסוק בענייני הפצ"רית, אך פרקליטות המדינה יכולה למלא את מקומה. אלא שאף שהדיונים בין האוצר לצה"ל נערכים לפחות חודשיים, כל הזמן הזה הצדדים הקפידו לשמור את המאבק לעצמם ולא לשתף באופן רשמי את משרד המשפטים. מי שעשוי להכריע בכך הוא בית המשפט, באם הפצ"רית תפנה לערכאות בדרישה לקבל את מלוא התגמולים שלטענתה מגיעים לה. עד אז, וללא הכרעה של גורם שלישי, לא נראה שהצדדים יוכלו להגיע להסדר מוסכם.
במכתב של החשכ"לית לראש אכ"א, אלוף דדו בר כליפא, היא תיארה את הפרשה כ"מקרה חריג ביותר" וטענה כי בצה"ל פעלו לקביעת זכויותיה הכספיות של הפצ"רית לשעבר תוך עקיפת מנגנוני הבקרה, ואף העבירו לה 90% מגמר החשבון כמקדמה – מבלי שחשב צה"ל ידע על כך. הטענה החריפה ביותר במכתב נוגעת למגעים שניהל אכ"א עם הפצ"רית לשעבר. לדברי החשבת, מההסברים שמסר צה"ל עולה כי "אכ"א ישב עם בא כוחה של הפצ"רית (שצה"ל נשא בעלות שכר הטרחה שלו) בנושא הגמלה וגמר החשבון והגיע איתו לסיכום". אלא שלדבריה, מאחר שהמהלך לא עבר את הבקרות הנדרשות בחשבות צה"ל, "לסיכום זה אין כל תוקף".
מדובר צה"ל נמסר: "הרמטכ"ל נקט, בהתאם לסמכותו, בצעדים חמורים וחסרי תקדים ביחס למתכונת הפרישה, ואף קבע שצעדים אלה בעניינה של הפצ"רית וצעדים נוספים ייבחנו בהתאם לסיום ההליך המשפטי המתנהל כנגדה. התייחסות החשבת הכללית במכתב שפורסם תיבחן יחד עמה ועם הגורמים הרלוונטיים בצה"ל בימים הקרובים, ותיענה באופן ענייני".